工资超过5000怎么扣税

1、工资纳税金额=（工资所得-五险一金-专项扣除金额）×适用税率-速算扣除数。

2、工资是先扣除五险一金再扣除个税的，其中社保和公积金是同步扣除，不存在先后顺序，扣完五险一金之后，再减去个税专项扣除项目，剩下的金额如果在5000元以上，就需要扣个人所得税，如果在5000元以下，就免除缴纳个税。