研究中通常使用blast来寻找什么

研究中通常使用blast来寻找蛋白质和基因。

在研究中，BLAST搜索是研究一个蛋白质或基因的最基本的方法之一。BLAST（Basic 讣嘬铮篌Local Alignment Search Tool）基本的局部相似性比对搜索工具。是用来将一个蛋白质或DNA序列和各种数据库中的其他序列进行比对的主要工具 （Altschul,1990,1997）。

BLAST检索第一次被提出是在Stephen　Altschul，David Lipman及同事的一篇经典文献（1990）中。这篇论文描述了BLAST检索的理论基础以及一些基本问题，例如灵敏度（正确度）和速度。晚些时候有对BLAST算法的重要修饰，包括间隔BLAST的引入。

BLAST的主要功能

1、BLAST可以确定特定的蛋白质或核酸序列有哪些已知的直系同源或旁系同源序列。

2、BLAST可以确定哪些蛋白质和基因在特定的物种中出现。

3、BLAST可以确定一个DNA或蛋白质序列身份。

4、BLAST可以发现新基因。

5、BLAST可以确定一个特定基因或者蛋白质有哪些已经被发现了的变种。

6、BLAST可以研究可能存在多种剪接方式的表达序列标签。

7、BLAST可以寻找对于一个蛋白质的功能和/或结构起关键作用的氨基酸残基。