lncRNA-Gene-Network网络图的含义

1、点：图中每个圆点代表一个基因，五边形代表一个lncRNA。

2、颜色：对于两分组（例如实验组和对照组），红色圆点为上调基因，红色五边形为上调lncRNA，亍陲驵哺蓝色圆点为下调基因，蓝色五边形为下调lncRNA，对于多分组（例如耘资诡拨组1，组2，组3），由于差异基因和差异lncRNA不分上、下调，所以紫色圆点为差异基因， 紫色五边形为差异lncRNA。

3、连线：两个点的共表达关系用连线表示，正相关用实线连接，负相关用虚线连接。

4、数量：一般基因数量建议控制在100-500左右，lncRNA数量控制在100-500左右，数量太少可能会由于关系太少，连不成网络图，数量太多网络图会太大，不便于后续挑选。

5、挑选：点的大小代表与之有共表达关系的懋鲕壶迎基因和lncRNA数量，点越大，代表与之有共表达关系的基因和lncRNA越多，推测祈硗樘缎其越重要，是网络图中的核心基因和lncRNA，可以挑选做后续的验证试验或进一步的分析。如上图中ENST00000384172，ENST00000384205是网络中核心的lncRNA，IL31RA，HHIP是网络中的核心基因。