进化树的构建方法
1、在NCBI上搜索所需的目的序列,以Metallothionein(MT)为例。
2、将所需目的序列复制到Word上,形成如图格式。
3、下一步用MEGA7构建进化树。首先打开MEGA,然后点击Align,点击Edit/Build Alignment,然后在弹出的小框中选择Create a new alignment,点击OK,根据你的需求选择Protein或DNA,如果比对的是核酸则点击DNA,若是蛋白质则点Protein.在此以Protein为例。
4、点击Protein,出现如下第一张图所示,然后将目的序列粘贴,变成第二张图所示。
5、点击Date菜单中的Phylogentic Analysis点击Yes,然后在主菜单中点击Analysis,点击Phylogeny并选择第二个。点击YES,然后在弹出的框中点击compute
6、下图即为所构建的进化树。
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