如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

2025-03-25 15:15:04

作为一名化学专业的人来说,经常要接触化学结构,而为了使分子结构更为清晰地表达出来,则需要借助chem3D,chem3D可使结构更为立体化与合理化,但是,在不知道分子构型,自己构建一个分子,则需要借助chemcraft,chemcraft可使分子构型更为美观,并能直观表达其立体坐标。通常,计算化学的人经常需要接触这两个软件。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

工具/原料

chemcraft软件

chem3D软件

UltraEdit软件

从chemcraft到chem3D

1、打开chemcraft软件,在操作界面上画出自己想要的分子结构,比方说H2O。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

2、点击coord按钮,复制坐标,或者点击右下方的copy按钮。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

3、打开UltraEdit软件,把刚刚复制的坐标粘贴到编辑栏里,选择列快模式,删除首列,只留下X,Y,Z坐标栏,并在首行插入分子的带电性、自旋多重度。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

4、另存为gjf格式,打开chem3D,将刚刚保存的gjf格式的文件直接拖动到chem3D中,即可实现chemcraft到chem3D的转化。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享
如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

从chem3D到chemcraft

1、打开chem3D软件,在操作界面上画出自己想要的分子结构,比方说H2O。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

2、然后调整下相关参数以达到自己想要的效果,比方说用球棍模型表达,最后另存为XYZ格式。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

3、运行UltraEdit软件,打开刚刚保存的XYZ格式的文件,转化为列快模式,选择复制原子及原子的XYZ坐标三列。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享
如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

4、打开chemcraft软件,点击coord按钮,再点击右下角的paste按钮。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享

5、点击Image按钮,就能看到美观的分子构型,从而实现chem3D到chemcraft的传输。

如何实现chemcraft与chem3D间文件的共享
声明:本网站引用、摘录或转载内容仅供网站访问者交流或参考,不代表本站立场,如存在版权或非法内容,请联系站长删除,联系邮箱:site.kefu@qq.com。
相关推荐
  • 阅读量:21
  • 阅读量:61
  • 阅读量:68
  • 阅读量:29
  • 阅读量:90
  • 猜你喜欢